Με την Άννα Κορακάκη και τον Λευτέρη Πετρούνια να μπαίνουν πρώτοι στο Ολυμπιακό Στάδιο του Τόκιο, ξεκίνησε η καθιερωμένη παρέλαση αθλητών στην τελετή έναρξης των Ολυμπιακών Αγώνων. Αμέσως μετά την ελληνική αποστολή, στο Στάδιο παρέλασε η Ολυμπιακή Ομάδα προσφύγων και ακολούθησαν οι χώρες σε σειρά, με βάση το ιαπωνικό αλφάβητο. Στο τέλος θα εισέλθουν στο Ολυμπιακό Στάδιο οι αποστολές των ΗΠΑ και της Γαλλίας, δηλαδή των δύο χωρών που θα φιλοξενήσουν τις δύο προσεχείς διοργανώσεις, και όπως πάντα την παρέλαση θα κλείσει η οικοδέσποινα Ιαπωνία.
Οι περισσότερες χώρες εφάρμοσαν την προτροπή της ΔΟΕ για έναν άνδρα και μία γυναίκα σημαιοφόρο. Ακολουθεί η λίστα των σημαιοφόρων αθλητών/τριών, κατά σειρά εισόδου στο Ολυμπιακό Στάδιο του Τόκιο:
ΧΩΡΑ ΑΘΛΗΤΡΙΑ (ΑΘΛΗΜΑ) ΑΘΛΗΤΗΣ (ΑΘΛΗΜΑ)
Ελλάδα Αννα Κορακάκη (Σκοποβολή) Λευτέρης Πετρούνιας (Γυμναστική)
Ολυμπιακή Ομάδα Προσφύγων Γιούσρα Μαρντίνι (Κολύμβηση) Τατσλοουίνι Γκαμπριγιέσος (Στίβος)
Ισλανδία Σναερφρίντουρ Σολ Γιορουναρντοτίρ Αντον ΜακΚι (Κολύμβηση)
(Κολύμβηση)
Ιρλανδία Κέλι Αν Χάρινγκτον (Πυγμαχία) Μπρένταν Ιρβάιν (Πυγμαχία)
Αζερμπαϊτζάν Φαριντά Αζίζοβα (Ταεκβοντό) Ρουστάν Ορούτζοφ (Τζούντο)
Αφγανιστάν Κίμια Γιουσόφι (Στίβος) Φαρζάντ Μανσουρί (Ταεκβοντό)
Ηνωμένα Αραβικά Εμιράτα ————— Γιουσούφ Αλματροόσι (Κολύμβηση)
Αλγερία Αμέλ Μελίχ (Κολύμβηση) Μοχάμεντ Φλίσι (Πυγμαχία)
Αργεντινή Σεσίλια Καράνσα Σαρόλι (Ιστιοπλοϊα) Σαντιάγο Ραούλ Λάνγκε (Ιστιοπλοϊα)
Αρούμπα Αλισον Πόνσον (Κολύμβηση) Μίκελ Σρόιντερς (Κολύμβηση)
Αλβανία Λουίζα Γκέγκα (Στίβος) Μπρίκεν Τσάλια (Αρση Βαρών)
Αρμενία Βαρσενίκ Μανουτσαριάν (Κολύμβηση) Χοβχάνες Μπάτσκοφ (Πυγμαχία)
Ανγκόλα Ναταλία Σάντος (Χάντμπολ) Ματίας Μοντίνιο (Ιστιοπλοϊα)
Αντίγκουα & Μπαρμπούντα Σαμάνθα Ρόμπερτς (Κολύμβηση) Τσεϊχάε Γκριν (Στίβος)
Ανδόρα Μόνια Ντόρια Βιλαρούμπλα Πολ Μόγια (Στίβος)
(Κάνοε/καγιάκ σλάλομ)